水稻类辅助蛋白家族的生物信息学分析  

王爱荣1,2 , 赵旭2 , 林文伟2 , 鲁国东2 , 王宗华2
1.福建农林大学计算机与信息学院, 福州, 350002
2.福建农林大学生物农药重点实验室, 福州, 350002
福建农林大学生物农药重点实验室,福州,350002
福建农林大学生物农药重点实验室,福州,350002
福建农林大学生物农药重点实验室,福州,350002
福建农林大学生物农药重点实验室,福州,350002
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2011 年, 第 30卷, 第 34 篇   doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0034
收稿日期: 2011年06月03日    接受日期: 2011年06月24日    发表日期: 2011年07月11日
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推荐引用:

引用格式(中文):
王爱荣等, 2011,水稻类辅助蛋白家族的生物信息学分析,基因组学与应用生物学(online), Vol.30 No.34 pp.1218-1223 (doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0034)
引用格式(英文):
Wang et al., 2011, Bioinformatic analysis of the auxilin-like protein family in rice, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), Vol.30 No.34 pp.1218-1223 (doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0034)

 

摘 要

辅助蛋白作为热激蛋白Hsc70的伴侣分子在网格蛋白介导的细胞内吞作用中起重要作用。在水稻中还未发现有关类辅助蛋白的相关研究。为了明确水稻类辅助蛋白的编码基因、种类及其功能,本文对其进行了一系列的生物信息学分析。结果发现水稻中共有16个编码类辅助蛋白的基因,而且都有表达证据存在。这16个基因在水稻不同组织和不同胁迫条件下的的表达情况存在较大差异,说明它们所具有的功能不同。此外,进化分析发现,水稻类辅助蛋白共分为3个亚类,它们的分化早于单子叶植物和双子叶植物的分化。研究结果为进一步研究该类蛋白的分子和生物学功能奠定了良好基础。

关键词
水稻;类辅助蛋白;基因家族;进化分析
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基因组学与应用生物学
• 第 30 卷
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