水牛LGALS3BP基因克隆及序列分析  

朱鹏 , 庞春英 , 段安琴 , 邓廷贤 , 陆杏蓉 , 梁贤威
中国农业科学院广西水牛研究所, 广西水牛遗传繁育重点实验室, 南宁, 530001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 106 篇   
收稿日期: 2015年12月09日    接受日期: 2016年01月14日
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摘 要

为了阐明水牛半乳糖凝集素3结合蛋白(Lectin, Galactoside-Binding, Soluble, 3 Binding Protein, LGALS3BP)基因的结构及功能,本试验采用了3’ RACE克隆获得LGALS3BP基因并对其进行了信息学分析。结果表明:水牛LGALS3BP基因编码区长1668 bp,3’UTR区长590 bp,编码555 个氨基酸。BLAST分析显示水牛LGALS3BP核苷酸序列与牛、绵羊、山羊、猪、马、猫、非洲象和人的相似性分别为97%、94%、94%、83%、84%、82%和82%,系统进化树分析结果表明,LGALS3BP基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明LGALS3BP蛋白呈弱酸性,第18-19 位氨基酸为其蛋白信号肽剪切区域,亚定位于细胞外,存在SR,BACK和BTB等结构域。microRNA预测显示bta-miR-2316,bta-miR-484和bta-miR-2888等可能为LGALS3BP 3’非翻译区(untranslated region, UTR)潜在靶标。研究结果为今后阐明LGALS3BP基因与水牛卵巢健康的关系,尤其是与水牛卵巢癌和卵巢囊肿的关系奠定了理论基础。

关键词
水牛;LGALS3BP;克隆分析
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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