严海月 , 张东明 , 刘大海

安徽大学生命科学学院干细胞及转化医学研究中心, 合肥, 230601
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 75 篇   
收稿日期: 2015年12月01日    接受日期: 2016年01月01日

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敲除β-catenin基因的第3号外显子可使其过表达。以往很多研究主要通过基因表达谱分析β-catenin过表达对肾脏发育产生的影响，并鉴定了多个关键基因。但相关通路及相关通路间的共表达模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究选取公共数据库GEO (Gene Expression Omnibus)中和β-catenin过表达肾脏转录组密切相关微阵列(microarray)数据集作为研究对象，并进行GSEA (Gene set enrichment analysis)分析，筛选相关转录因子。结果：我们鉴定出了63条被β-catenin上调的通路如Notch信号通路(Notch signaling pathway)，以及43条被下调的通路如ABC转运体(ABC transporters)等通路。最终，我们构建了包含有核心基因的相关通路共表达网络，我们的研究结果将帮助我们更好地在全基因组层面上了解β-catenin对于小鼠肾脏发育的调控作用。

β-catenin；肾脏；发育不全；基因表达谱；调控机制