Smad1在结直肠癌中的突变及功能分析  

林巾琳1 , 谭震2 , 丛茜1 , 贾浩1 , 阮辛森1 , 刘慧娟1
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 381 篇   
收稿日期: 2016年05月10日    接受日期: 2016年05月10日
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摘 要

DNA损伤是肿瘤发生的基础,细胞内应答DNA损伤的分子信号通路是阻挡癌症发生的屏障。近年来发现Smad1在DNA损伤应答的分子信号通路中具有重要的作用。本实验旨在探究结直肠癌患者组织中Smad1的序列突变及其生物学意义。本实验提取结直肠癌患者肿瘤组织和正常组织的总RNA并逆转录成cDNA,分段扩增Smad1基因并进行克隆和双向测序,测序结果进行比对,发现Smad1的MH1区域与MH2区域的错义突变较少,6个主要的错义突变均集中在Linker区域,其氨基酸残基改变分别是:N147H,P167S,T202A,M218I,M247V和A248V,其中Thr202是已知的GSK3作用位点;正常组织及肿瘤组织中的突变情况不同,T202A和M218I分别是仅存在于正常组织和肿瘤组织中的突变,提示Smad1 Linker区域的突变可能影响其生物学功能。并利用RNAfold和SOPMA在线服务器分别预测发现错义突变对Smad1的RNA二级结构和蛋白质二级结构造成不同程度的影响。

关键词
结直肠癌;肿瘤发生;DNA损伤应答;Smad1
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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