兴义鸭MEF2A基因克隆及生物信息学分析  

赵忠海 1,2 , 李辉 1,2 , 彭邦星 1,2 , 陆曼 1,2 , 卜小雁 1,2 , 康建兵 1,2 , 师新彩 1,2 , 张蓉 1
1贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 134 篇   
收稿日期: 2015年12月28日    接受日期: 2016年02月01日
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摘 要

为了获取鸭MEF2A基因完整编码区(CDS)序列,进一步揭示其遗传机理。本试验采用兴义鸭为研究对象,采用RT-PCR方法克隆获取MEF2A基因CDS区序列,经重组质粒测序、拼接,试验初步获得了兴义鸭MEF2A基因完整编码区序列,得到1 479 bp片段,包含起始密码子和终止密码子,编码492个氨基酸,表达蛋白分子量为53.14 kD。经序列对比,在G429A、T661A、A1423G、A1426G和G1467A分别发生了单核苷酸突变,其中T661A和A1423G突变分别导致Cys (半胱氨酸)到Ser (丝氨酸)、Glu (谷氨酸)到Lys (赖氨酸)的改变,其他位点均属于同义突变。试验对兴义鸭MEF2A蛋白的理化性质及结构特点进行了简单分析,为下一步研究MEF2A蛋白特性及其作用机制奠定理论基础。

 

关键词
MEF2A基因;克隆;生物信息学;兴义鸭
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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