泥河湾大长梁遗址和马圈沟Ⅰ文化层放线菌的分离及系统发育分析  

程娟娟 , 赵徐平 , 汤晖 , 张利平
河北大学, 生命科学学院, 河北省微生物多样性研究与应用实验室, 保定, 071001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 143 篇   
收稿日期: 2015年12月28日    接受日期: 2016年02月01日
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摘 要

为分析泥河湾盆地大长梁考古地层和马圈沟Ⅰ文化层中可培养放线菌的物种多样性,本实验通过平板稀释涂布法对该区域土样进行放线菌的物种分离,得到197株放线菌纯培养物。采用链霉菌属特异引物对放线菌纯培养物进行初步鉴定,确定 143株放线菌归属于链霉菌属。对未被鉴定的54株放线菌进行16S rDNA全序列测定并分析其系统发育关系。最终,将197株放线菌归属于放线菌纲下的5个亚目,6个科,10个属。其中,马圈沟Ⅰ文化层的分离菌株12-9与类诺卡氏菌属(Nocardioides)的Nocardioides albus KCTC 9186T之间的16S rDNA序列相似性是93.73%,可能是一个潜在新属;大长梁考古地层的分离菌株18-64与Haloglycomyces albus YIM 92370T的16S rDNA序列相似性是93.64%,可能是一个潜在新属。

关键词
泥河湾;放线菌;物种分离;16S rDNA
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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