一个水稻长芒基因AWN-2的定位与克隆  

韦敏益1,2 , 吴子帅1,2 , 刘立龙1,2 , 李允振1,2 , 农春晓2 , 覃宝祥1,2,3 , 李容柏1,2,3
1广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁, 530004; 2广西大学农学院, 南宁, 530004; 3广西大学植物遗传育种重点实验室, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 144 篇   
收稿日期: 2015年12月28日    接受日期: 2016年02月02日
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摘 要

本研究在以广西普通野生稻DP30为供体,籼稻品种9311为受体构建的染色体片段代换系中,筛选鉴定出1份稳定遗传的具有长芒表型的染色体片段代换系。利用该代换系与轮回亲本9311构建了BC5F2分离群体,对控制长芒表型的基因进行了遗传分析,发现该群体中长芒与短芒的单株分离比符合3:1的比例,表明该长芒性状受一对显性核基因控制。采用图位克隆法,将目的基因精细定位于水稻第4染色体分子标记M7和M8之间的12.14kb范围内,该区域只有一个候选基因即LOC_Os04g43840,测序分析发现与栽培稻日本晴、9311相比,CSSL5的LOC_Os04g43840基因在5’UTR区有29个碱基的缺失和2个碱基的置换,因此,推测LOC_Os04g43840可能为该长芒候选基因。

关键词
水稻;长芒;基因定位;克隆
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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