香猪5个单核苷酸位点的多态性与产仔数的关联分析  

梅子凌1 , 王洋1 , 刘畅1 , 牛秋锦2 , 谢玲玲2 , 牛熙1 , 王嘉福1,3 , 冉雪琴2
1贵州大学农业生物工程重点实验室/生命科学学院, 贵阳, 550025; 2贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 3铜仁学院, 铜仁, 554300
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 178 篇   
收稿日期: 2016年01月01日    接受日期: 2016年02月02日
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摘 要

为了寻找影响猪产仔数的功能基因,本文选取5个候选SNP位点CASI0003452,DIAS0001380,ALGA0071919,MARC0052565和ALGA0045832采用等位基因特异PCR方法对候选位点的多态性变化进行群体研究。结果表明:香猪群体中C452位点以BB基因型为主,低产香猪群的B等位基因频率明显高于高产群(P<0.05),香猪群A等位基因频率高于大白猪(P<0.05)。D380位点,香猪的A等位基因频率高于大白猪,且与乳头数呈弱相关;A919和M565位点的基因型均为CC型,没有多态性;猪群间A832位点的等位基因频率的差异不显著。经测序证实D380位点处于C1GALT1基因外显子1中,属于同义密码子突变,但存在密码子偏好性,可能影响香猪C1GALT1基因的表达,可能与香猪的性早熟有关。C452位于基因PDIA4基因第四内含子中,可能影响PDIA4基因表达量,从而影响猪的卵母细胞成熟、受精及胚胎的早期发育。

关键词
香猪;产仔数;单核苷酸多态性;C1GALT1基因;PDIA4基因
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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