大豆叶绿素含量QTL定位及候选基因预测  

李伟1 , 潘校成3 , 于洪潇1 , 齐慧冬1 , 毛新瑞1 , 黄仕钰1 , 王新宇1 , 尹振功2 , 倪忠秋1 , 齐照明1 , 陈庆山1
1大豆生物学教育部重点实验室, 东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150030; 2黑龙江省农科院, 哈尔滨, 150028; 3中国65301部队农副业基地, 五大连池, 164100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 251 篇   
收稿日期: 2016年02月15日    接受日期: 2016年03月22日
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摘 要

叶绿素是调节光合作用的关键色素,对籽粒形成有着重要作用。本研究以Charleston和东农594为亲本,构建了含147个株系的重组自交系群体,以F2:21代重组自交系为试验材料,基于经SLAF测序获得的大豆高密度遗传图谱,利用复合区间作图法(CIM)、多重区间作图法(MIM)和完备区间作图法(ICIM)对大豆叶绿素含量进行QTL联合定位分析,并结合大豆基因组基因注释信息对QTL区段内的候选基因进行预测。利用CIM算法定位出2个QTL,表型遗传贡献率分别为6%和9.3%。利用MIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为8.1%。利用ICIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为7.76%。其中qchl-G-1被CIM和MIM两种算法同时检测到。在上述3个QTL区段内共含有151个基因,根据大豆基因组基因注释信息,筛选到了3与叶绿素相关的候选基因,这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论基础,有利于分子辅助育种的发展。

关键词
大豆;叶绿素含量; 高密度图谱; QTL定位
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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