贵州大眼鳜3个群体rDNA ITS-1序列分析  

郭健康 , 安苗 , 曹恒源 , 李珊 , 陈薛伟杰
贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 209 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

运用PCR扩增技术及DNA测序技术,对贵州3个大眼鳜群体的ITS-1序列进行了分析,结果显示:3个大眼鳜群体存在序列长度多态性,主要有753 bp和755 bp两种类型,GC (72.8   %)平均含量远高于AT含量(27.3);共检测到6个多态位点,产生6种单倍型;3个群体各自都表现出较低的遗传多样性水平,从总体上看,单倍型多样性指数为0.622,表明贵州大眼鳜群体的遗传多样性较丰富。在贵州大眼鳜ITS-1序列中发现(GC)n、(CT)n、(CG)n、(TCG)n4种微卫星序列,其中(GC)n出现的频率最高。群体间的遗传分化指数(Fst)和基因交流值(Nm)均表明,铜仁大眼鳜群体与沿河大眼群体遗传分化小,有基因交流;而关岭大眼鳜群体与这两个群体间,遗传分化大,缺乏基因交流。

 
关键词
大眼鳜;ITS-1;遗传多样性
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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