基于转录组测序的马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR内参基因筛选与鉴定  

陶玉婷1 , 卢姗1 , 王超1 , 王俊杰1 , 康雪晴1 , 蓝秀万1,2,3,4 , 梁晓乐2 , 梁莹3,5 , 何志义3,6
1广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室, 南宁, 530021; 2广西医科大学基础医学中心实验室, 南宁, 5300212; 3广西高校基础医学研究重点实验室, 南宁, 530021; 4广西高校生物分子医学研究重点实验室, 南宁, 530021; 5广西医科大学基础医学院微生物学教研室, 南宁, 530021; 6广西医科大学第一附属医院呼吸科, 南宁, 530021
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 184 篇   
收稿日期: 2015年12月31日    接受日期: 2016年02月03日
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摘 要

马尔尼菲青霉菌是一种温度依赖性双相型条件致病真菌,可感染免疫缺陷人群,区域流行于东南亚地和我国南方,但其双相转换和致病性分子机制尚不清楚。实时荧光定量PCR是马尔尼菲青霉菌双相转换和致病性分子机制研究的重要手段,仍缺乏用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析的理想的内参基因。本研究根据转录组测序数据筛选了四个表达最稳定的Pfp;Rpl23;FacpA;DigA 基因与传统的内参基因18SrRNA;β-actin (Act1);β-tubulin (Btu) 作为候选内参基因,用BestKeeper和geNorm软件对其进行基因表达稳定性分析。结果表明FacpA和DigA基因在马尔尼菲青霉菌双相转换过程中表达最为稳定,可作为内参基因用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析。

关键词
马尔尼菲青霉菌;内参基因;实时荧光定量PCR;DigA基因;FacpA基因
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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