何晓峰¹ , 杨慧林^1，2 , 张志斌² , 汪涯¹ , 颜日明² , 朱笃^1，2

1江西科技师范大学生命科学学院, 江西省生物加工过程重点实验室, 南昌, 330013; 2江西师范大学生命科学学院, 江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室, 南昌, 330022
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 314 篇   
收稿日期: 2016年03月15日    接受日期: 2016年04月11日

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小单孢菌(Micromonospora rosaria) DSM 803是一种高GC含量的革兰氏阳性放线菌，分离自美国德克萨斯州土壤，能够合成玫瑰霉素抗生素。目前，还没有相关研究报道Micromonospora rosaria的全基因组序列，这限制了代谢产物合成途径和比较基因组学等研究。本研究首次通过高通量测序技术对小单孢菌DSM 803进行全基因组测序，使用Velvet软件进行组装拼接得到310个Contigs，整个基因组大小约7.38 Mbp，GC含量为73.4%，序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库(LRQV00000000)。比较基因组学及玫瑰霉素合成途径相关基因分析结果显示：小单孢菌DSM 803在碳水化合物转运和代谢及信号转导功能方面要明显强于其它功能；玫瑰霉素生物合成基因簇由20个基因组成并分散于4个Contigs中。本研究首次报道了一株大环内酯类抗生素玫瑰霉素生产菌小单孢菌DSM 803的全基因组序列，分析了基因组基本特征，预测了次级代谢产物合成基因簇，探讨了玫瑰霉素生物合成途径，为后续的进一步代谢调控与合成生物学提供了理论基础。

小单孢菌； 全基因组测序；玫瑰霉素； 基因簇；比较基因组分析