鞠林芳 , 段尚尧 , 张妍 , 哈斯阿古拉 , 牛一丁

内蒙古大学生命科学学院, 内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 呼和浩特, 010021
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 328 篇   
收稿日期: 2016年04月05日    接受日期: 2016年05月15日

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本文采用生物信息学的方法对甜瓜数据库中的甜瓜乙烯应答因子基因ERFⅠ-14 (登录号: MELO3C014441)的启动子特性、RNA结构、理化性质、导肽、信号肽、跨膜结构域、蛋白质二级结构、三级结构及功能域等进行预测和推断。结果表明，CmERFⅠ-14基因的开放阅读框(ORF)长645 bp，编码214个氨基酸，蛋白质的分子量约为23 kD，理论等电点为6.59，不存在导肽和信号肽，无跨膜结构域，二级结构中最主要的结构元件是无规则卷曲，包含一个AP2/ERF功能结构域，预测到8个可能的互作蛋白和多个启动子元件，没有预测到CpG岛。系统发育分析发现，其与黄瓜ERF3-like蛋白(XP_004140127.1)亲缘关系最近。

甜瓜；乙烯应答因子； ERF；生物信息学分析