王云生¹ , 文光琴² , 聂飞³

1凯里学院环境与生命科学学院,　凯里, 556011; 2贵州省植物园, 贵阳, 550004; 3贵州省生物研究所, 贵阳, 550000
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 303 篇   
收稿日期: 2016年03月22日    接受日期: 2016年04月20日

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蓝莓营养丰富，富含花青素等抗氧化性活性物质，被誉为“小浆果之王”。为了加深对蓝莓优良品种“瑞蓝”生长发育分子机制的了解，利用第二代测序技术对其2年生苗的幼叶转录组进行测序。获得总共约1G的有效测序数据，共拼装成41987 条unigenes，其中23555条unigenes能被GO数据库成功注释，分别涉及到生物学过程、细胞成分及分子功能相关的共35种生理代谢功能；20379条unigenes能被KOG数据库注视到，共涉及25条代谢通路；9771条unigenes 能被KEGG数据库成功注释，共涉及到5个大类、20个中类、124条代谢通路；27293条unigenes 被Nr数据库成功注释，这些unigenes共对应32949条蛋白质的编码区。同时，生物信息学分析还显示：全部unigenes中，有5221条unigenes编码转录因子，涉及到54个家族；2487条unigenes编码抗性基因，涉及19个家族；共检测到6261个SSR序列，其中2碱基重复的SSR占68.2%。转录组测序分析结果阐明了“瑞蓝”的生长发育的部分分子信息，对利用其进一步开展分子标记辅助育种等具有较为重要的意义。

蓝莓；转录组；生物信息学；代谢通路；转录因子