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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 398 篇
收稿日期: 2016年05月11日 接受日期: 2016年06月11日
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 398 篇
收稿日期: 2016年05月11日 接受日期: 2016年06月11日
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摘 要
摘 要 通过分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对Rho GAP家族进行序列分析,运用RT-PCR技术获得了该家族基因的部分cDNA序列,通过实时荧光定量技术分析Rho GAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个Rho GAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个Rho GTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同Rho GAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明RhoGAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究Rho GAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。
关键词
稻瘟病菌;RhoGAP;生物信息学;几丁质合酶;Real-time PCR
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