张春华¹ , 刘洪² , 俞明亮¹ , 葛安静³ , 董清华³

1. 江苏省农业科学院园艺研究所, 南京, 210014
2. 南京农业大学园艺学院, 南京, 210095
3. 北京农学院植物科学技术学院, 北京, 102206
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2011 年, 第 30卷, 第 41 篇   doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0041
收稿日期: 2011年07月04日    接受日期: 2011年07月21日    发表日期: 2011年07月25日

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推荐引用：

引用格式(中文)：
张春华等, 2011,草莓NAC基因家族生物信息学分析,基因组学与应用生物学(online), Vol.30 No.41 pp.1261-1271 (doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0041)
引用格式(英文)：
Zhang et al., 2011, Bioinformatics analysis of the NAC gene family in strawberry, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), Vol.30 No.41 pp.1261-1271 (doi: 10.5376/gab.cn.2011.30.0041)

NAC基因家族是植物特有的且具多种生物功能的转录因子，该家族基因广泛参与多个植物生长发育过程以及生物与非生物逆境应答等。进行草莓NAC基因家族信息发掘对于草莓及其它蔷薇科植物的遗传改良方面具有深远前景。本文利用生物信息学方法对132个NAC基因在连锁群上的分布、假定NAC蛋白质的分类、理化特性及结构进行了预测和分析。结果显示具有NAC结构域的132条草莓氨基酸序列认为是假定NAC蛋白质，它们与拟南芥94个NAC氨基酸序列共分为18个亚族；连锁群定位结果发现其中114个草莓NAC基因分布在草莓1-7号连锁群上，其余18个基因未能搜索出其所属连锁群。不同亚族间草莓假定NAC蛋白质理化特性存在一定的差异；其中125个草莓假定NAC蛋白质二级结构以无规则卷曲为主要构成元件，其余7个以α-螺旋为主要构成元件。132个假定NAC蛋白质中有121个具有三级结构，且它们的三级结构大部分相似。

草莓；拟南芥；NAC基因家族；生物信息学