绿壳蛋鸡LSm14A基因克隆与组织分布分析  

伍昌华1 , 温贵兰1,2 , 张升波1 , 罗金木1 , 林汉卿1 , 文明1,2 , 嵇辛勤1,2 , 周碧君1,2 , 王开功1,2 , 程振涛1,2 , 汪德生1,2 , 龚新勇1,2
1贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 187 篇   
收稿日期: 2016年02月04日    接受日期: 2016年03月09日
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摘 要

为探明绿壳蛋鸡LSm14A分子序列特征与其在绿壳蛋鸡体内不同组织中的分布情况。本研究利用RT-PCR方法扩增LSm14A基因编码区全长序列并进行克隆测序。利用DNAStar软件对LSm14A基因与鸭、人、鼠等其他13个物种的LSm14A基因核苷酸、氨基酸序列进行比对分析,并对绿壳蛋鸡LSm14A基因所编码的蛋白进行了二级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。同时采用实时荧光定量PCR方法检测绿壳蛋鸡源LSm14A基因在绿壳蛋鸡不同组织中的转录水平差异。绿壳蛋鸡LSm14A基因克隆结果显示:绿壳蛋鸡LSm14A全长CDS1386bp编码461个氨基酸;与原鸡源LSm14A相似性达99.6%,与鸭源的LSm14A相似性为94.7%,与人源、猴源、猪源、爪蟾的LSm14A相似性较低;系统进化树显示其序列与原鸡的亲缘关系最近,且处于同一遗传进化分枝。绿壳蛋鸡LSm14A基因编码蛋白结构预测结果显示:绿壳蛋鸡LSm14A基因编码蛋白亲水性较好,为非分泌蛋白,含有Sm1Sm2基序和FDF结构域,不存在跨膜结构;荧光定量结果显示:LSm14A分子在绿壳蛋鸡不同组织中均有分布且有不同程度的表达,在免疫器官法氏囊、胸腺中表达较高,而在肝脏中表达最低。本研究结果说明绿壳蛋鸡LSm14A分子具有较高的保守性,在绿壳蛋鸡不同组织中呈广泛性表达,在禽类中枢免疫器官中呈高水平表达,研究结果为研究LSm14A分子在天然免疫中的作用机制、防控禽类病毒性疾病奠定基础。

关键词
绿壳蛋鸡;LSm14A;组织分布
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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