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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 273 篇
收稿日期: 2016年02月01日 接受日期: 2016年03月01日
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 273 篇
收稿日期: 2016年02月01日 接受日期: 2016年03月01日
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摘 要
疣蝗分布广泛,是一种常见的害虫,主要危害农作物,但分子信息缺乏。我们采用高通量Illumina测序技术和头组装的方法获得了疣蝗转录组unigenes,并鉴定了天然免疫相关信号通路基因。本研究共获得疣蝗转录组unigenes 86 756个,平均长度为670 bp, N50 为1 033 bp。使用六大数据库Nr, Nt, Swiss-Prot, GO,COG和KEGG注释疣蝗转录组unigenes, 分别对应有29 627,13 866, 23 393, 13 474, 11 968和21 027个unigenes 获得注释。本研究共鉴定319个天然免疫信号通路相关的unigenes,其中,参与Toll通路的unigenes 49个,参与免疫缺失 (IMD) 通路的unigenes 13个,参与 JAK-STAT 信号通路的unigenes 117个, 参与MAPK-fly通路相关的unigenes 58个,参与黑化(Melanization)通路的unigenes 82个。另外,我们还预测到了9 287个SSRs。本研究为疣蝗基因功能分析、免疫通路相关基因和分子标记的进一步研究提供了分子理论基础
关键词
疣蝗;转录组;天然免疫;SSRs
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