冯慧^1,2 , 冯成利¹ , 黄原² , 王璐¹

1陕西省动物研究所, 西安, 710032; 2陕西师范大学, 西安, 710062
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 355 篇   
收稿日期: 2016年04月11日    接受日期: 2016年05月16日

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利用长距离PCR扩增法对秦岭羚牛线粒体基因组进行测序、拼接、注释并对基因组特点和羚牛系统发育进行分析。结果表明，羚牛线粒体基因组全长为16 662bp，GenBank序列号：KU361169。该基因由13个蛋白编码基因、22个转运RNA基因、2个核糖体RNA基因和1个非编码控制区组成。基因组核苷酸组成为A: 33.9%，T: 27.0%，C: 26.3%，G: 12.8%，A+T含量（60.9%）高于G+C含量（39.1%），有一定的碱基偏好。ND2，ND3，ND5基因起始密码子为ATA，其余10个蛋白质编码基因起始密码子为ATG。ND2、ND3、ND4、COIII基因为不完全终止密码子T，其余蛋白质基因为完全终止密码子TAA和AGA。预测了22个tRNA二级结构，共有38处错配，以GU错配为主。基于14种有蹄类动物线粒体基因组构建的系统发生树，表明羚牛与山羊亲缘关系最近，应归为羊亚科。

羚牛；线粒体基因组；RNA二级结构；系统进化