贺理¹ , 邓红玉² , 王晓春¹

作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 282 篇   
收稿日期: 2016年02月02日    接受日期: 2016年03月03日

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摘要：目的  探讨卵巢癌中差异表达的长链非编码RNA。方法  从NCBI基因芯片数据库GEO下载卵巢癌基因芯片数据GSE14407，用SAM软件输出差异表达的基因，对其进行重注释并筛选出其中的长链非编码RNA，用Gene Cluster 和TreeView软件验证筛选出的长链非编码RNA的表达情况。结果  针对该芯片数据，筛出133个在卵巢癌中表达有差异的长链非编码RNA，其中112个上调，21个下调，且这些长链非编码RNA的表达倍数均＞2或＜0.5，差异有统计学意义（q值＜0.05）。结论  用生物信息学方法挖掘普通基因芯片中卵巢癌相关长链非编码RNA是十分有效的方法，可为卵巢癌相关长链非编码RNA的探索提供新途径。

卵巢癌；长链非编码RNA；基因芯片；生物信息学