徐伟^1,2 , 黄兰^1,2 , 封竣淇^1,2 , 康建兵^1,2 , 钱成^1,2 , 蔡惠芬^1,2 , 罗卫星^1,2

1贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵州大学动物科学学院, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳, 550025
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基因组学与应用生物学, 2017 年, 第 36卷, 第 30 篇   
收稿日期: 2016年08月10日    接受日期: 2016年09月15日

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为研究贵州黑山羊、贵州白山羊MHC-DRB1基因遗传机制，试验运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法，对MHC-DRB1基因第三外显子区域进行多态性分析，利用生物信息学分析软件对PCR扩增所获序列进行mRNA二级结构及蛋白质的二级结构和抗原表位分析。经序列对比发现9个SNPs位点，其中A⁸⁸⁵⁸G (ILe-Val)、G⁸⁹⁶⁹A (Gly-Ser)、G⁸⁹⁷⁸A (Glu-Lys)、T⁹⁰⁹⁴G (Asp-Glu) 4个单核苷酸突变，导致所编码氨基酸发生改变，其它5个位点均属于同义突变。进一步分析发现，A⁸⁸⁵⁸G、C⁸⁹⁷⁴T、T⁹⁰⁹⁴G、C⁹¹⁰⁰T、G⁹¹²⁴A突变位点导致mRNA二级结构的变化，A⁸⁸⁵⁸G以及T⁹⁰⁹⁴G对蛋白质二级结构影响最大。

DRB1基因；多态性；生物信息学；山羊