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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 284 篇
收稿日期: 2016年02月08日 接受日期: 2016年03月08日
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 284 篇
收稿日期: 2016年02月08日 接受日期: 2016年03月08日
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摘 要
本研究采用第二代测序技术对四川华绿螽的基因组进行了测序,并组装得到了完整的线粒体基因组序列。结果显示:四川华绿螽线粒体基因组序列全长18,051 bp,包含37个基因和1个控制区。与已测序的螽亚目昆虫类似的是,具有通常的基因方向、tRNA结构、相对较低的A+T偏好性。然而,基因排列与典型的节肢动物线粒体基因组有明显不同,具有新的基因排序12S rRNA-tRNAIle-tRNAMet-nad2-CR-tRNAGln-tRNATrp。控制区较长,为3,074 bp,由两部分组成,一部分是与nad2相邻的高A+T偏向性区,另一部分是与tRNAGln相邻的重复序列区。另外,在tRNASer(UCN)和nad1之间有一段长度为123 bp的基因间隔区。基于已测序的线粒体基因组序列,我们对直翅目昆虫线粒体基因组的结构和排序进行了比较分析。本研究结果为直翅目系统发生关系重建积累了有价值的数据资料。
关键词
四川华绿螽;线粒体基因组;直翅目;基因结构;基因重排
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