利用肝脏转录组数据分析地山雀的适应性进化  

韩宝银1 , 徐舒阳2 , 陈艳红2
1贵州师范学院化学与生命科学学院, 贵阳, 550018; 2武汉大学生命科学学院, 武汉, 430072
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 509 篇   
收稿日期: 2016年07月18日    接受日期: 2016年08月23日
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摘 要

肝脏是生物新陈代谢的重要器官。为了探究青藏高原特有鸟类地山雀(Parus humilis)如何适应低温、低氧等恶劣环境,我们对其肝脏转录组数据进行分析,并结合斑胸草雀基因组数据进行了比较研究。结果显示,地山雀肝脏转录组中的大部分高表达基因都直接参与机体的新陈代谢活动;通过与斑胸草雀基因组数据进行比较,对筛选出的214个快速进化基因进行代谢通路的功能富集,发现多数基因富集到与能量代谢、免疫反应和消化相关的通路上。本研究表明,高表达基因的功能一方面验证了肝脏是机体新陈代谢的主要场所,参与胆汁分泌、脂肪酸的转化及解毒等多项生理活动;另一方面也说明这些高表达基因对于维持肝脏的正常功能是必要的。快速进化基因的功能富集分析揭示了地山雀中与能量代谢、免疫反应和食性等相关的基因受到自然选择压力的影响而发生了适应性的快速进化。

关键词
地山雀;转录组;高表达基因;快速进化基因;适应性进化
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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