大豆GmC4H基因的克隆及同源基因的生物信息学分析  

张东雪 , 王艳 , 井妍 , 吴德鹏 , 李冬梅 , 韩英鹏 , 赵雪 , 李文滨 , 武小霞
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 408 篇   
收稿日期: 2016年05月11日    接受日期: 2016年06月11日
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摘 要

本研究分别在大豆品种中豆27和九农20中克隆大豆肉桂酸-4-羟化酶基因(Glyma.20G114200),得到长度为1797bp的C4H基因cDNA序列。比对两者cDNA序列发现4个碱基差异位点。通过对二者氨基酸序列进行理化性质及结构与功能分析发现,C4H基因编码蛋白在5~24位氨基酸之间和32~55位氨基酸之间存在跨膜区域;C4H蛋白含有细胞色素P450结构域。大豆C4H基因的四个拷贝分别分布于第 2、10、14 和 20 号染色体上,Glyma.20G114200与Glyma.10G275600的蛋白质同源性高,而另外两个同源基因Glyma.02G236500和Glyma.14G205200的蛋白质同源性高,分析可能大豆4个C4H同源基因在进化过程中发生了功能的较大分化。

关键词
大豆;异黄酮;C4H;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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