CYP2E1基因单核苷酸多态性在从江香猪中的分布  

杨家大1 , 任琼2 , 吴声榕3
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 409 篇   
收稿日期: 2016年05月11日    接受日期: 2016年06月14日
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摘 要

为了解CYP2E1基因单核苷酸多态性在从江香猪中的分布,积累从江香猪药物代谢模型基础资料,应用SnaPshot分型技术对141份从江香猪样品CYP2E1基因13个错义突变位点进行基因分型,并统计群体遗传学指标。结果显示:rs694867178 、rs693643523、rs321622043、rs706465876、rs690804887、rs707424098、rs698846226、rs708577553、rs695879722和rs80932038共10个位点表现为单态,rs793477975、rs691870665和rs80969284共3个位点表现为多态。多态位点的基因型分布频率为:rs793477975(CC 95.74%、CT 4.26%)、rs691870665(AA 9.93%、AG 32.62%、GG 57.45%)、rs80969284(AA 7.8%、AG 33.33%和GG 58.87%);等位基因分布频率为:rs793477975(C 99.87%、T 2.13%)、rs691870665(A 26.24%、G 73.76%)、rs80969284(A 24.47%、G 75.53%)。rs793477975位点多态信息含量、杂合度、香农信息指数都很低,有效等位基因数小,变异小;rs691870665和rs80969284位点多态信息含量、杂合度、香农信息指数都较高,有效等位基因数较大,遗传变异较大。结果提示,从江香猪CYP2E1基因总体上纯合度高,在药物代谢动物模型开发上具有良好基础。

关键词
从江香猪;CYP2E1;单核苷酸多态性
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基因组学与应用生物学
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