赵懿琛^1,2 , 刘雪薇^1,3 , 李岩^1,3 , 赵德刚^1,3

贵州大学1山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/贵州省山地生态与农业生物工程2011协同创新中心; 2药学院; 3生命科学学院/农业生物工程研究院, 贵阳, 550025
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 272 篇   
收稿日期: 2016年02月10日    接受日期: 2016年03月17日

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采用2代Illumina Hi-Seq 测序技术对朝仓花椒雌株结果期幼芽的转录组进行测序，构建了转录组数据库，获得49,672,080条Clean Reads数据，包含总长度为4,967,208,000 nt序列数据信息；经拼接组装，获得转录组基因信息长达55,902,243nt的176,407个Contig片段，再通过进一步拼接，共获得平均长度为878nt的96,475个Unigene片段。与Nt、Nr、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG等数据库进行BLAST信息比对(E-value≦10^-5)，共获得68,315个注释基因，以及62150个表达序列标签（EST）。 与NR数据库比对，发现花椒转录组基因序列与同科柑橘属的甜橙和克莱门柚具有较高的同源性，分别为43.96%及41.86%，与其他物种的同源性较低，均不足10%；以Unigene与COG数据库比对，可将杜仲转录组Unigene的功能分为25类，根据GO功能可分生物过程、细胞组分和分子功能3大类55分支，与KEGG数据库比较，朝仓花椒转录组数据共含有128类代谢通路的基因，包括多种氨基酸生物合成、脂肪酸代谢、糖代谢，尤其是次生物质代谢途径较多，如萜类化合物生物合成、黄酮与黄酮醇生物合成、花青素生物合成等。

花椒；转录组；基因