袁柳娇 , 余如凤 , 钟军弟 , 刘锴栋 , 黎海利 , 袁长春 , 陈燕

岭南师范学院生命科学与技术学院, 湛江, 524048
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2017 年, 第 36卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2016年08月11日    接受日期: 2016年09月15日

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为优化建立木榄的SCoT-PCR体系，利用建立的SCoT方法进行分析木榄不同地理种源的遗传多样性，基于L₂₅(5⁶)正交设计，本研究在5个水平上优化试验了5个影响木榄SCoT-PCR的因素：模板DNA、Mg²⁺、dNTPs、Taq酶和引物。同时，运用优化的SCoT体系对木榄8个不同地理种源进行遗传多样性分析。研究结果建立了木榄SCoT-PCR最佳反应体系(20 μL)：模板DNA 20 ng，引物0.75 μmol/L，dNTPs 0.5 mmol/L，Mg²⁺ 2.5 mmol/L，Taq酶1.25 U。同时，筛选出了带谱清晰、多态性丰富的16条SCoT引物进行遗传多样性分析。共扩增出115个位点，其中73个为多态性位点，多态性比例为62.33%。从UPGMA聚类和PCoA分析结果可以看出8个地理种源间的遗传多样性及亲缘关系。研究表明SCoT分子标记可以用于木榄种群的遗传多样性。

木榄；SCoT标记；体系优化；遗传多样性