谢红卫¹ , 钱明娟¹ , 潘境涛² , 袁林峰¹ , 蔡怡聪³ , 毛凌华¹ , 李永辉¹ , 曹志斌¹ , 聂元元¹ , 颜龙安¹ , 蔡耀辉¹

作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 416 篇   
收稿日期: 2016年05月14日    接受日期: 2016年06月14日

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为了开发一套用于水稻细胞质多态性鉴定的分子标记，本研究通过对已测序的4个水稻线粒体基因组CW-CMS、LD-CMS、Nipponbare和9311线粒体基因组进行比较分析，获得55个大于100 bp的线粒体特异序列，并开发出一套水稻线粒体特异序列分子标记。该套分子标记稳定可靠，在对随机选择的23个水稻品种的线粒体组型鉴定中，共有24个线粒体特异标记扩增出多态性，使用 UPGMA法聚类分析，在相似系数为0.46，可以将23水稻品种分为2大类群，其中第一大群可分为两个小类群，类群I为粳稻聚类群，该类群大部分为粳稻品种，同时也有2个籼稻品种，推测这两个品种细胞质来源于粳稻；类群II包含两个籼稻品种，与粳稻的细胞质亲缘关系较近；而第二大聚类群全部为籼稻品种，大部分品种间多态性丰富。因此，该套水稻线粒体特异序列标记可用于水稻细胞质多态性鉴定分析，同时该类型分子标记的开发对于其他物种的细胞质多态性鉴定具有指导意义。

线粒体特异序列；细胞质；分子标记；水稻