基于基因组De novo测序的离子束重组沙漠寡营养细菌的16s rRNA基因研究  

Pei-Hong ,
新疆大学, 物理科学与技术学院, 离子束生物技术中心, 乌鲁木齐, 830046
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2017 年, 第 36卷, 第 46 篇   
收稿日期: 2016年08月09日    接受日期: 2016年09月13日
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摘 要

为了进一步理解低能N+注入在沙漠寡营养细菌(DOB)系统发育与进化中的作用,本研究基于DOB基因组De novo测序数据,应用生物信息学方法对三株离子束重组菌株DOB073、DOB113和DOB981的16S rRNA基因的突变与进化进行了分析。分析表明,三株离子束重组DOB的16S rRNA基因拷贝数均比原始菌株增加了5个,并分别在C1区、V1区、V2区、V4区、V6区、V7和V9区发生了碱基突变。进化分析显示DOB981的进化速度快于DOB073和DOB113。16S rRNA的保守二级结构预测表明,9个保守二级结构所处碱基位置分别为:80~120、120~240、240~360、360~480、400~520、640~760、760~880、800~920和1 420~1 540。本研究为低能离子注入介导的原核微生物进化提供了直接的分子证据。

关键词
低能N+ 注入;沙漠寡营养细菌(DOB);基因组;16s rRNA;进化
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基因组学与应用生物学
• 第 36 卷
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