贺亮 , 刘丽 , 廖健 , 聂俊杰 , 王中铎

广东海洋大学水产学院, 湛江, 524025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2017 年, 第 36卷, 第 38 篇   
收稿日期: 2016年08月09日    接受日期: 2016年09月14日

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以海陵岛近岸优势物种舟山缰虾虎鱼(Amoya chusanensis)、纵带鹦虾虎鱼(Exyrias puntang)为研究对象，获取2种虾虎鱼的线粒体COI基因序列45条，控制区(D-loop)序列48条，分析其序列变异情况和遗传特征。结果表明：获得的638 bp COI序列中，舟山缰虾虎鱼存在变异位点20个，纵带鹦虾虎鱼变异位点占18个。467 bp控制区中，舟山缰虾虎鱼变异位点10个，纵带鹦虾虎鱼占19个。碱基组成上，2种虾虎鱼COI基因和控制区序列均存在A+T含量大于C+G含量现象，且COI基因序列中碱基T偏向密码子第一位。最大似然法估算的COI序列转换颠换R比值为2.89，控制区序列R值为2.66。聚类分析揭示舟山缰虾虎鱼在进化上较原始，更接近祖先物种，而纵带鹦虾虎鱼种群分化较晚。单倍型分析指明2种虾虎鱼单倍型多样性均处在较高水平。中性检验的Fu-Li D分析发现，基于COI基因和控制区序列的舟山缰虾虎鱼的检验结果均显著，不符合中性进化假设，纵带鹦虾虎鱼Fu-Li D test的结果均呈现不显著，符合中性进化假设。舟山缰虾虎鱼种群间可能存在群体扩张或持续增长现象。

海陵岛；虾虎鱼；COI基因；控制区；遗传分析