李根亮¹ , 许苡侥¹ , 卢舒雨¹ , 黄晓敏¹ , 农嵩¹ , 蒋利和²

1右江民族医学院, 百色, 533000; 2广西大学动物科学与技术学院, 南宁, 530004
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 470 篇   
收稿日期: 2016年06月21日    接受日期: 2016年07月27日

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本研究通过hMeDIP-Seq 技术和生物信息学分析，从肝细胞癌模型小鼠肝癌组织和肝组织基因组羟甲基化的角度研究肝癌相关信号通路，以期探讨肝癌相关信号分子基因的羟甲基化分布及其与基因表达的关系。研究结果表明，肝癌组织中共有52个具有显著统计学意义的肝癌相关信号分子基因发生了羟(FDR<0.05)，而肝组织的则没有出现有统计学意义的相关羟甲基化信号分子基因。而且，这些信号分子基因的羟甲基化位点全部分布在基因表达的调控区域(外显子外)，包括启动子-转录启始位点区、内含子区和基因间区。由于DNA羟甲基化是激活基因表达的重要手段，因此，这些区域的羟甲基化表明这些基因在肝癌组织中处于激活状态，并得到了RT-qPCR实验的抽样证明。由此可见，肝癌组织基因组上发生的羟甲基化与肝癌相关；它们通过激活大量的信号分子基因引起肝癌相关信号通路的异常活化，从而引起肝癌的发生或迁移。

hMeDIP-seq；肝癌；信号分子基因；DNA羟甲基化