广西3个猪种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性及系统进化研究  

綦文晶 1 , 何剑雄 1 , 郭晓萍 1 , 兰干球 1 , 谢文斌 2 , 蒋钦杨 1 , 杨秀荣 1 , 郭亚芬 1
1广西大学动物科学技术学院, 南宁, 530004; 2靖西原石农牧实业有限公司, 百色, 533800
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 369 篇   
收稿日期: 2016年04月11日    接受日期: 2016年05月16日
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摘 要

本研究旨在了解广西石头猪、德保猪和隆林猪的起源、群体遗传结构和亲缘关系。通过PCR扩增和测序技术获得3个群体61个个体的线粒体D-loop序列,采用DNASP 5.0进行多态性分析,MEGA6.0计算各品种间的遗传距离及构建系统发育树。结果显示,3个猪种mtDNA D-loop区全长1124-1325bp,石头猪和德保猪的中间重复序列变异仅存在A型,隆林猪存在A型和B型;石头猪mtDNA D-loop区8个多态性位点归纳出10种单倍型,德保猪8个多态性位点归纳出5种单倍型,隆林猪11个多态性位点归纳出9种单倍型;三种猪单倍型多样度分别为0.857、0.81和0.917,核算多样度分别为0.00229、0.0029和0.00283。石头猪和德保猪可能有相同的母源血统,隆林猪可能有2种母系起源;3个品种猪单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性匮乏,亟需进行科学保护。

关键词
石头猪;德保猪;隆林猪;线粒体DNA D-loop;遗传多样性;系统进化
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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