1海南师范大学生命科学学院, 热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室, 海口, 571158; 2东北林业大学盐碱地生物环境研究中心, 东北油田盐碱植被与恢复教育部重点实验室, 哈尔滨, 150040; 3浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所, 诸暨, 311800
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 512 篇
收稿日期: 2016年07月24日 接受日期: 2016年08月22日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 512 篇
收稿日期: 2016年07月24日 接受日期: 2016年08月22日
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摘 要
移动遗传因子普遍存在于苏云金芽孢杆菌(Bt)基因组中,而且大部分位于Bt毒素基因两侧附近,与Bt毒素基因进化和转移密切相关。本研究完成了一株对鳞翅目昆虫表现出很强的杀虫活性的Bt菌株HS66的基因组序列草图测定,并利用本地BLAST软件和ISFinder软件,进行了插入序列和转座子序列的查找及基本信息的汇总,结果表明Bt HS66基因组序列含有丰富的插入序列和转座子序列。转座因子分析是整个Bt HS66基因组分析过程中的重要的一环,后续工作中若定位移动因子在染色体及质粒序列的位置,对解析转座因子功能,帮助预测相关杀虫基因信息,以及全面理解Bt HS66基因组将有极大的帮助。
关键词
插入序列;转座子;Illumina测序;苏云金芽孢杆菌
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