研究报告/Research Report
烟草黑胫病胁迫相关miRNA鉴定及功能分析 
黄飞燕1 
,
叶贤文2 ,
王戈3* 
,
何晓健1,4 ,
张柳1 ,
杨焕文3*
,
叶贤文2 ,
王戈3* ,
何晓健1,4 ,
张柳1 ,
杨焕文3*
1 云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201;2 云南省烟草公司昆明市公司安宁分公司, 昆明, 650300; 3 云南农业大学烟草学院, 昆明,650201;4 红云红河烟草(集团)有限责任公司, 昆明, 650231
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 52 篇
收稿日期: 2017年01月04日 接受日期: 2017年01月06日 发表日期: 2018年01月25日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 52 篇
收稿日期: 2017年01月04日 接受日期: 2017年01月06日 发表日期: 2018年01月25日
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摘 要
MicroRNAs 是一类非编码 RNA 分子，通过 RNA 沉默在转录后水平调控基因表达，在响应非生物和生物胁迫中扮演重要角色。本研究为了阐明烟草黑胫病抗病分子机制，构建了抗病品种云 87 接菌前 0 h和接菌后 12 h、 24 h、 48 h 和 72 h 茎部组织的 5 个小 RNA 文库。运用 solexa 高通量测序技术鉴定出 565 个已知 miRNAs (代表 63 个 miRNA 家族)和 187 个新 miRNAs。在黑胫病菌胁迫下，总共有 156 个 miRNA 差异表达，大部分差异表达 miRNA 聚类到 profile 18、 profile 15 和 profile 9 等 3 种显著性动态表达模式，并用qRT-PCR 方法验证部分差异表达 miRNA 表达模式。靶基因预测和功能分析表明，差异表达 miRNA 主要参与调控防御响应、转录因子或信号级联途径和不同生理过程相关基因表达。本研究初步揭示了烟草与黑胫病非亲和互作间在转录后水平上的调控机制，为培育抗黑胫病烟草品种提供 miRNA 水平的理论依据
关键词
烟草；黑胫病；miRNA；功能分析
