中国林业科学研究院林业研究所, 北京, 100091
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 44 篇
收稿日期: 2016年11月17日 接受日期: 2017年01月17日 发表日期: 2018年01月25日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 44 篇
收稿日期: 2016年11月17日 接受日期: 2017年01月17日 发表日期: 2018年01月25日
© 2018 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
LBD (lateral organ boundaries domain)蛋白是一类植物所特有的转录因子,在调控植物生长发育、营养代谢以及逆境胁迫的响应等方面发挥重要作用。然而,在基因组水平上对毛果杨LBD基因家族的研究还未曾有过报道。本研究利用生物信息学方法,从毛果杨基因组中鉴定出57个LBD基因并预测其分子量和等电点,这些基因分布于毛果杨18条染色体和Scaffold_65、Scaffold_86上。该家族成员基因结构简单,内含子数目不超过2个。进化关系分析显示毛果杨LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。分析基因表达模式发现,该家族成员的表达具有一定时空特异性,并响应氮素胁迫处理。本研究为深入研究毛果杨LBD基因的功能奠定了基础。
关键词
毛果杨;LBD基因家族;系统进化分析;基因表达