岳靓¹ , 陈吉祥^1* , 杨智² , 李彦林² , 芮文鸿¹ , 王永刚²

1兰州理工大学石油化工学院, 兰州, 730050;
2兰州理工大学能源与动力学院, 兰州, 730050
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 41 篇   
收稿日期: 2017年01月19日    接受日期: 2017年11月18日    发表日期: 2018年01月25日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

复苏促进因子(Rpf)广泛存在于高G+C含量的革兰氏阳性细菌中，与细菌生长及抵抗不良环境有关，不同细菌Rpf种类和数量有一定差异。红平红球菌(Rhodococcus erythropolis) KB1分离自石油污染土壤，具有高效石油降解能力和环境适应性。为探索Rpf在红平红球菌KB1适应环境过程中作用，设计了复苏因子基因特异引物，从红平红球菌KB1基因组DNA扩增出4种rpf基因。序列分析发现4种基因分别与藤黄微球菌(Micrococcus luteus) rpf基因，结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis) rpfB、rpfC及链霉菌(Streptomyces coelicolor) rpfB相似性较高。4个rpf基因编码蛋白都有一个类似Mt细胞复苏促进因子Rpf域，由大约70个氨基酸组成。其中Rpf-1与结核分枝杆菌、链霉菌RpfC相似，只含1个Rpf结构域；Rpf-2与结核分枝杆菌RpfB相似，含有1个Rpf域、1个G5域和2个DUF348；Rpf-3与链霉菌RpfB相似，含有1个Rpf域、G5域和3个DUF348；Rpf-4与藤黄微球菌Rpf相似，含1个Rpf域和1个LysM域。Rpf-2、Rpf-3含信号肽序列，Rpf-1、Rpf-4不含信号肽。

红平红球菌；复苏促进因子；基因；结构域；非可培养