李慧敏^1,2 , 陈丹^2,3

1 云南民族大学数学与计算机科学学院, 昆明, 650031;
2 云南大学生物资源保护和利用重点实验室, 昆明, 650091;
3 云南大学数学与统计学院, 昆明, 650091
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2012年03月02日    接受日期: 2012年03月16日

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内含子在基因转录调控中的作用已多次被实验报道，然而对其参与调控的普遍性还缺乏足够的理论支持。本研究利用计算分析方法，对小鼠基因内含子中的CpG岛(CpG island)、TATA框(TATA box)、CAAT框(CAAT box)以及GC框(GC box)等元件的出现频率进行分析。结果发现，分别有56.01%、57.16%、65.88%和41.86%的第一内含子具有CpG岛、TATA框、CAAT框以及GC框，而它们在其它内含子中的平均出现频率则分别为14.07%、45.24%、49.91%和13.19%。即使考虑到不同位置的内含子，这些元件在第一内含子中的出现频率也显著高于在它们在其它任何位置内含子中的出现频率。由于CpG岛、TATA框、CAAT框以及GC框均与基因的转录调控有关，据此推测小鼠第一内含子在基因转录调控过程中具有潜在的重要性。本研究结果为内含子参与转录调控提供了更多的理论依据。

小鼠； 内含子； CpG岛； 调控元件；计算分析