刘朋虎 , 邓优锦 , 江玉姬 , 谢宝贵 , 王海英 , 章小寅

福建农林大学菌物研究中心, 福州市, 350002
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2012年03月13日    接受日期: 2012年03月29日

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采用Solexa测序技术，对草菇菌丝体和原基进行了数字基因表达谱(DGE)测序，在菌丝体和原基文库中分别得到5701781和5659262个高质量测序标签(clean tags)，对应的标签种数(distinct clean tags)分别为85626、95363。将所有高质量测序标签与参考基因库进行比对，在菌丝体和原基文库中，占标签种数的43.32%和52.57% 的标签可以唯一定位(map)到参考序列上，占标签种数的21.65%和21.47%的标签可以被定位到基因组序列上。最终，被菌丝体和原基标签唯一定位的基因数(unambiguous tag-mapped genes)分别为14794、15534。差异基因分析显示，两个文库中共有显著性差异表达的基因4163个，其中在原基中上调、下调的基因数分别为2486和1677，只在原基中表达的基因321个。经过Blastnr比对，在原基中特异表达的基因，涉及蛋白质(氨基酸)合成与代谢、糖代谢、脂类代谢和抗逆反应等多个代谢途径。GO功能富集分析结果表明，葡萄糖、己糖和乙醇等代谢途径大部分基因下调表达。Pathway功能富集分析结果表明，合成核糖体蛋白的基因均下调表达，表明原基形成时细胞代谢减弱，蛋白质合成量减小。

草菇； 子实体形成； 数字基因表达谱； 差异表达基因