姚晶¹ , 顾文亮¹ , 夏启玉² , 胡新文¹ , 郭建春²

1 海南大学农学院, 海口, 570228;
2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2012年03月09日    接受日期: 2012年03月23日

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马宾灵(MabinlinⅡ)是中国所特有的植物甜蛋白，在目前已知的七种植物甜蛋白中具有最佳的热稳定性，将其作为新型甜味剂有着广阔的市场前景。本研究以马宾灵的氨基酸序列为基础，采用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法预测马宾灵的二级结构，采用Karplus-Schulz方法预测马宾灵的蛋白质骨架区柔韧性，采用Kyte-Doolittle方法预测马宾灵的蛋白质疏水性，采用Emini方法预测马宾灵的蛋白质表面可能性，采用Jameson-Wolf方法预测马宾灵的B细胞抗原表位。分析结果表明，马宾灵的A链多形成转角和无规则卷曲结构，A链的N端27~30区段形成较柔软的蛋白质骨架结构，A链的N端4~6、7~9、10~11、12~14、20~22、23~26和30~33区段为抗原位点的可能性较大；马宾灵的B链多形成β折叠和转角结构，B链的N端0~7、9~13、28~29、33~34、40~45、53~54和55~57区段为抗原位点的可能性较大。本研究以生物信息学手段分析预测马宾灵的二级结构及其B细胞抗原表位，为设计马宾灵多克隆抗体以检测马宾灵在不同生物反应器中的表达研究提供参考数据。

植物甜蛋白；马宾灵； 二级结构；B细胞抗原表位