史卫东¹ , 黄如葵¹ , 王益奎¹ , 周建辉¹ , 赵坤¹ , 李秋雯²

1广西农科院蔬菜研究所, 南宁, 530007;
2广西农业职业技术学院, 南宁, 530007
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 65 篇   
收稿日期: 2012年07月31日    接受日期: 2012年09月03日

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本研究利用MSAP检测18个芥蓝齐口期DNA甲基化水平，分析了表观遗传多样性，探讨DNA甲基化模式对齐口期的影响。结果表明，18个芥蓝齐口期平均为50 d，叶片数平均为10片，齐口期和叶片数不相关(相关系数为0.296)；变异系数分别为21%和18%；遗传距离分布在0~40，平均值为12.227 6，在10.62处分为3类。MSAP分析表明，5对引物组合扩增得到432条多态性条带，201条片段表现出多态性，多态性比率为47%；Nei遗传距离分布在0.004~0.467，平均值为0.0958，表明遗传多样性水平较低；在0.04处分为3类。Mantel测验表明两种分析的遗传距离相关系数为-0.1366，显示齐口期、叶片数与DNA甲基化多态性没有相关性。DNA甲基化模式分析表明，非甲基化片段为110条，甲基化多态性片段为322条，分为3种带型，类型一为非甲基化带型(110条)，类型二为甲基化带型(110条)，类型三为半甲基化带型(152条)，非甲基化片段和半甲基化片段在不同品种之间呈现多态性，甲基化片段在不同品种之间呈现多态性与单态性相差不大，显示MSAP多态性主要来源于非甲基化和半甲基化片段，芥蓝甲基化模式以半甲基化为主。本文推测DNA甲基化水平降低参与芥蓝齐口期调控，MSAP分析即可用于基因组结构研究，又可用于基因组水平上性状的功能研究。

芥蓝；表观遗传多样性；MSAP分析