河南省农业科学院园艺研究所, 郑州, 450002
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 51 篇
收稿日期: 2017年03月27日 接受日期: 2017年05月02日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 51 篇
收稿日期: 2017年03月27日 接受日期: 2017年05月02日
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摘 要
蝴蝶兰在种苗生产中主要是以腋芽再生的方式进行苗繁育。以大辣椒、四季春2个蝴蝶兰品种为试材,利用Illumina HiSeq-(TM)2000测序平台研究了他们在组织培养过程中3个诱导增殖阶段的转录组特性。结果表面,通过测序共获得52.77Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到6.78Gb,Q30碱基百分比在92.47%以上。对Clean Data进行过滤并组装,共获得86130条Unigenes;其中长度在1kb以上的Unigenes有16723条。参照无参基因组在数据库中进行比对分析,有28430条Unigenes可进行有效注释。对2个品种、3个诱导增殖阶段的全部Unigenes进行SNP分析表明,四季春的杂合性SNP分布密度明显低于大辣椒品种。另外,对转录组数据进行了差异表达基因分析,共获得7638条差显基因。
关键词
蝴蝶兰;腋芽;转录组;基因表达
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