基于线粒体COⅠ及Cyt b基因的7种龙虾类分子系统关系  

姚维 , 刘楚吾 , 刘丽
广东海洋大学水产学院, 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室, 湛江, 524025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 69 篇   
收稿日期: 2012年05月04日    接受日期: 2012年08月07日
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摘 要(Provisional)

运用PCR法扩增湛江沿海海域7种龙虾的线粒体COⅠ和Cyt b基因并对其序列进行分析,以分析7种龙虾的分子系统关系。从7种龙虾中扩增到的COⅠ基因片段长度均为650 bp,共存在224个核苷酸位点变异,变异率为35.22%,简约信息位点161个;扩增到的Cyt b基因片段长度均为536 bp,共存在148个核苷酸位点变异,变异率为29.48%,简约信息位点66个。所有的扩增序列中,没有发现碱基的缺失以及插入,序列中的转换大于颠换,且碱基替换多发生于密码子的第3位。以帝加洛真龙虾(Palinurus delagoae)、普通真龙虾(Palinurus elephas)、吉氏真龙虾(Palinurus gilchristi)为外群,对COⅠ和Cyt b两个基因序列采用最大简约法(maximum parsimony, MP)和贝叶斯推论法(bayesian inference, BI)构建龙虾类分子系统树。结果显示:日本龙虾和密毛龙虾亲缘关系比较近,而其它5种龙虾与真龙虾属的3种关系较近,与传统的分类存在一定分歧。

关键词
龙虾;线粒体;COⅠ;Cyt b;分子系统树
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基因组学与应用生物学
• 第 31 卷
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