邓传良 , 高俊 , 曹莹 , 秦瑞云 , 高武军 , 卢龙斗

河南师范大学生命科学学院, 新乡, 453007
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 74 篇   
收稿日期: 2012年06月08日    接受日期: 2012年08月26日

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为了明确菠菜EST序列中SSR的总体特点，开发菠菜EST-SSR引物；为利用EST-SSR引物进行菠菜性别相关特异序列的克隆奠定基础，本文从NCBI上获得1 093条EST，并利用在线软件SSRIT检测所含SSR序列，并进行分析。共检索出68条SSR序列，分布于64条EST中，检出率为6.22%，包括22种重复基元。其中二核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位，占总SSR数目的32.3%。利用在线引物设计软件Primer 3.0设计了7对EST-SSR引物，在适合的PCR反应体系下，分别以雌、雄菠菜DNA基因组为模板，对设计的EST-SSR引物进行筛选，结果显示以EST序列HS097148设计的一对引物从菠菜雌雄基因组中扩增出一条雄性特异的条带，表明通过菠菜EST-SSR引物获得菠菜性别相关特异序列是可行的。

菠菜；表达序列标签；微卫星