焦钰 , 杜晓东 , 王庆恒 , 黄荣莲 , 邓岳文

广东海洋大学水产学院, 湛江, 524025
作者    通讯作者
水生生物研究, 2014 年, 第 3卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2014年05月13日    接受日期: 2014年05月30日    发表日期: 2014年06月10日

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推荐引用：

引用格式(中文):

焦钰等, 2014, 马氏珠母贝IKKε同源基因的克隆及表达分析, 基因组学与应用生物学, 33(2): 266-272 (doi: 10.13417/j.gab.033.000266)

引用格式(英文):

Jiao et al., 2014, Molecular Characterization and Expression Analysis of PmIKKε cDNA from Pinctada martensii, Genomics and Applied Biology (Online), 33(2): 266-272 (doi: 10.13417/j.gab.033.000266)

IKKε (inhibitor of NF-κB kinases ε)是NF-κB (nucleur factor κB)信号通路中的关键成员，参与调控细胞的分化、发育、凋亡及免疫反应。本研究根据马氏珠母贝转录组数据库中注释为IKKε的unigene序列设计引物，应用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝(Pinctada martensii) IKKε 基因cDNA的全长序列(PmIKKε)并对其序列特征进行分析；同时利用荧光定量PCR (Real-time PCR)技术检测了马氏珠母贝六个组织中PmIKKε基因mRNA的表达。结果表明：PmIKKε基因cDNA全长2 843 bp，其中5' UTR 为116 bp，3' UTR 为516 bp，含有27 bp polyA，开放阅读框为2 211 bp，编码737 个氨基酸残基。预测其分子量为85.07 kD，等电点为6.17。多序列比对显示PmIKKε与其它物种IKKε有较高的同源性，与牡蛎的序列相似性有45%。软件分析结果显示PmIKKε的N端含有一个蛋白激酶功能结构域和一个MAPKK (mitogen-activated protein kinase kinase)的激活位点，C 端含有一个亮氨酸拉链(leucin zipper, LZ)和一个螺旋- 环-螺旋结构(helix-loop-helix, HLH)。荧光定量PCR分析表明PmIKKε在马氏珠母贝肝胰脏、性腺、血淋巴、鳃、外套膜、闭壳肌六个组织中均有表达，肝胰脏中表达量最高。本研究为进一步阐述PmIKKε在马氏珠母贝生长、发育及先天性免疫中的作用提供理论基础。

IKKε； Pinctada martensii； 基因克隆； 荧光定量PCR