2贵州省农业生物技术重点实验室, 贵阳, 550006;
3贵州省生物技术研究所, 贵阳, 550006;
4贵州省农业科学院, 贵阳, 550006
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2013 年, 第 2卷, 第 1 篇
收稿日期: 2013年01月21日 接受日期: 2013年01月21日 发表日期: 2013年01月21日
引用格式(中文):
刘荣, 谭玉梅, 刘永翔, 刘作易, 2013, 谢瓦氏曲霉间型变种(Aspergillus chevalieri var. intermedius) esdC 基因全长 cDNA 克隆与序列分析, 基因组学与应用生物学, 32(1): 36-40
引用格式(英文):
Liu R., Tan Y.M., Liu Y.X., and Liu Z.Y., 2013, cDNA Cloning and Sequence Analysis of esdC Gene from Aspergillus chevalieri var. intermedius, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 32(1): 36-40
为探究 esdC 基因在谢瓦氏曲霉间型变种的结构特征,从已构建的抑制性差减文库(SSH)中筛选得到 esdC 基因的 EST 序列,采用 cDNA 末端快速扩增(RACE)技术扩增该基因片段的 5' 和 3' 端,拼接得到全长 cDNA 1 472 bp。通过序列分析,该 cDNA 序列含有一个开放阅读框(ORF),长度为 819 bp,从 396 ~1 214 bp,含有 30 个腺嘌呤尾巴。预测编码 273 个氨基酸,该蛋白质的等电点 pI 为 9.51,分子量为 30.265 58 kD,为不稳定 蛋白。序列同源性分析表明:该基因与费希新萨托菌(Neosartorya fischeri NRRL 181)有性发育蛋白 EsdC 相似 度最高,为 78%,其保守区序列主要集中于蛋白质的 N 端。本实验为进一步研究 esdC 基因的分子功能及可能 参与的调控途径奠定基础。