李旭娟 , 刘洪博 , 林秀琴 , 吴转娣 , 徐超华 , 刘新龙

云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室, 开远, 661699
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2015年02月26日    接受日期: 2015年02月26日    发表日期: 2015年02月26日

本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015年，第34卷，第01期上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

引用格式(中文)：

李旭娟, 刘洪博, 林秀琴, 吴转娣, 徐超华, 刘新龙, 2015, 甘蔗KNOX基因 (Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 34(1): 136-142

引用格式(英文)：

Li X.J., Liu H.b., Lin X.Q., Wu Z.D., Xu C.H., and Liu X.L., 2015, In Silico Cloning and Bioinformatics Analysis of KNOX Gene in Sugarcane (Sckn1), Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 34(1): 136-142

KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1, Oskn1)为参考序列，采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1，并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明：该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框，编码 356个氨基酸，分子量为 39.36 kD，理论等电点为 6.47。该基因很可能定位于细胞核，起转录调控作用，序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等 KN1 蛋白高度相似。以上分析结果为进一步 研究 Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。

 

甘蔗；KNOX基因；电子克隆；生物信息学分析