2广西高校生物分子医学研究重点实验室, 南宁, 530021;
3广东医学院药学院, 东莞, 523808;
4桂林医学院, 桂林, 541004
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2016 年, 第 5卷, 第 1 篇
收稿日期: 2016年02月10日 接受日期: 2016年02月10日 发表日期: 2016年02月10日
引用格式(中文):
马成通, 钱洁颖, 刘镛, 陶晨陈, 苏荷玲, 晁耐霞, 吴耀生, 2016, 白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 35(1): 183-189 (doi: 10.13417/j.gab.035.000183)
引用格式(英文):
Ma C.T., Qian J.Y., Liu Y., Tao C.C., Su H.L., Chao N.X., and Wu Y.S., 2016, Cloning and Bioinformatic Analysis of Squalene Synthase Gene from White Cucumber, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 35(1): 183-189 (doi: 10.13417/j.gab.035.000183)
为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase, SS)基因cDNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 kD。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。