研究报告/Research Report

苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析  

姚攀锋1 , 赵学荣1 , 李茂菲1 , 王安虎2 , 吴琦1
1四川农业大学生命科学学院, 雅安, 625014;
2西昌学院, 西昌, 615000
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2016 年, 第 5卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2016年03月10日    接受日期: 2016年03月10日    发表日期: 2016年03月10日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2016年第35卷第2期429-435页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):

姚攀锋, 赵学荣, 李茂菲, 王安虎, 吴琦, 2016, 苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析, 基因组学与应用生物学, 35(2): 429-435 (doi: 10.13417/j.gab.035.000429)

引用格式(英文):

Yao P.F., Zhao X.R., Li M.F., Wang A.H., and Wu Q., 2016, Cloning and Expression Analysis of Transcription Factor Gene FtbHLH3 from Fagopyrum tataricum under Abiotic Stress, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 35(2): 429-435 (doi: 10.13417/j.gab.035.000429)

摘 要

根据苦荞花期转录组数据,采用RT-PCR技术和PCR技术克隆得到一条新的bHLH类蛋白基因FtbHLH3 (登录号: KU296217),并分析了逆境胁迫下该基因在芽期苦荞胚轴和子叶中的表达量。结果显示,FtbHLH3基因cDNA全长1 273 bp,包含一个957 bp的开放阅读框,编码蛋白含318个氨基酸。蛋白结构域分析表明,FtbHLH3编码蛋白N-端和C-端分别含有一个bHLH家族典型的结构域。系统进化树分析表明,FtbHLH3与其它植物参与抗逆的bHLH蛋白聚为一簇。荧光定量PCR分析表明,UV-B处理苦荞后,胚轴中FtbHLH3相对表达量在6 h内缓慢增加至1.08,12 h后显著上升至48 h的2.96;而子叶中FtbHLH3相对表达量在3 h后就显著上升,至24 h达到最大值6.64后趋于稳定。4℃冷处理苦荞后,胚轴和子叶中FtbHLH3相对表达量均随时间持续上升,并在48 h后达到最大值,分别为3.22和10.27。可见,本研究克隆的FtbHLH3基因可能参与了苦荞对UV-B和寒冷等非生物胁迫的应答反应。

关键词
苦荞;bHLH转录因子;基因克隆;非生物胁迫
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计算分子生物学
• 第 5 卷
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