研究报告

江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析  

盘道兴1 , 王振1 , 杨茂林2 , 廖乔平3 , 杨昌平3 , 吴宇萍3 , 谢海强1 , 刘若余1
1贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳, 550025
2贵州省江口县科技局, 铜仁, 554400; 3贵州省江口县畜牧局, 铜仁, 554400
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2015年03月28日    接受日期: 2015年03月28日    发表日期: 2015年03月28日
© 2015 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015年,第34卷,第01期上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):

盘道兴, 王振, 杨茂林, 廖乔平, 杨昌平, 吴宇萍, 谢海强, 刘若余, 2015, 江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 34(1): 47-52

引用格式(英文):

Pan D.X., Wang Z., Yang M.L., Liao Q.P., Yang C.P., Wu Y.P., Xie H.Q., and Liu R.Y., 2015, SNP Screening and Bioinformatics Analysis of the Main Family Genes of FABPs in Jiangkou Luobo Pig, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 34(1): 47-52 

摘 要

以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用直接测序技术对猪L-FABP、I-FABP、H-FABP、A-FABP基因进行SNPs快速筛查,共检测出7个SNPs,分别为intron1-T1745C、exon2-T125C、exon2-A131C、exon2-C153A、exon2-A65T、exon2-G40A、intron3-C65T。其中intron1-T1745C、intron3-C65T 位于内含子上;exon2-T125C、exon2-C153A 为同义突变;exon2-A131C、exon2-A65T、exon2-G40A为错义突变,分别使编码氨基酸发生Glu→Ala,Lys→Met,Glu→Lys的改变,对其进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算,mRNA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均有差异。

关键词
江口萝卜猪;脂肪酸结合蛋白基因;SNPs;生物信息学
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计算分子生物学
• 第 4 卷
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