研究报告

几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析  

巴德仁贵 , 李爽 , 王绍萌 , 马勇 , 哈斯阿古拉
内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 呼和浩特, 010021
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2015年04月28日    接受日期: 2015年04月28日    发表日期: 2015年04月28日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015年,第34卷,第02期上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):

巴德仁贵, 李爽, 王绍萌, 马勇, 哈斯阿古拉, 2015, 几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 34(2): 382-391

引用格式(英文):

Bade Rengui, Li S., Wang S.M., Ma Y., and Hasi Agula, 2015, Bioinformatical Analysis of VACVase-like Gene from Several Plants, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 34(2): 382-391

摘 要

以拟南芥和蓖麻为重点,利用生物信息学对不同植物的类伐昔洛韦水解酶(valacyclovir hydrolase-like, VACVase-Like)蛋白的理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、导肽、亲疏水性、二级结构及三级结构等进行预测和分析,并构建了该家族系统发生树。结果表明,除了可可树属于稳定蛋白外,其余均属于不稳定蛋白。该基因家族均含有明显的信号肽、导肽、跨膜结构和亲疏水结构,且结构组成上相似,属于分泌蛋白,但是对亚细胞定位分析发现,在不同植物中存在和发挥功能部位均不相同。分析结果可为植物VACVase-like的研究提供有价值的信息,为进一步研究其在植物体内的功能和作用机理提供依据。

关键词
类伐昔洛韦水解酶;生物信息学;α/β水解酶
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计算分子生物学
• 第 4 卷
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